1. Baktērijas sadala bojā gājušos organismus līdz ogļskābajai gāzei, ūdenim un minerālvielām. Pateicoties šim procesam, notiek vielu riņķojums dabā.
2. Baktērijas uzlabo augsnes auglību. Piemēram, slāpekļsaistītājas baktērijas, kas uz zirņu un citu tauriņziežu saknēm veido gumiņus, saista un padara augiem izmantojamu gaisa slāpekli. 
Baktērijas, kas izmanto barībai bojā gājušu organismu organiskās vielas, sauc par saprofītiem.
Baktērijas, kas izmanto dzīvu organismu organiskās vielas, sauc par parazītiem.
Tauriņziežu dzimtas augus pēc ražas novākšanas iesaka ieart zemē - ar visiem gumiņiem un slāpekļa baktērijām, lai bagātinātu augsni ar slāpekli.
Pupiņas sakne ar baktēriju veidotajiem gumiņiem.
3. Pienskābās baktērijas cilvēki izmanto skābpiena produktu iegūšanai. Šīs baktērijas sastopamas pienā, uz dzīvnieku un cilvēku gļotādas un zarnās.
4. Etiķa iegūšanai izmanto baktērijas, kas sastopamas uz augļiem.
5. Siera nogatavināšanai izmanto baktērijas, kas sastopamas dzīvnieku barības traktā.
6. Baktērijas, kas ierosina slimības, sauc par patogēnajām baktērijām. Baktēriju ierosinātas ir tādas slimības kā tuberkuloze, sifiliss, salmoneloze.